אזור עמק יזרעאל נמצא בצפון מדינת ישראל. גודלו כ- 250 אלף דונם של שדות חקלאיים.
בעקבות ההשקיה התחיל השטח סבל ממפלסי מי תהום גבוהים והתמלחות הקרקע במים. מכשולים פיזיים כמו סוללות של מאגרים, ובמקרה הנ"ל סוללת רכבת העמק, גורמים להחמרת תופעות אלו המעלה הסוללה.
אחד השטחים שצמוד לסוללת רכבת העמק הוא שטח יפיע 7 של קיבוץ מזרע, בו בוצע ניקוז תת קרקעי בכדי לנטרל את תופעת ההמלחה ולהוריד את מפלס מי התהום.
עד היום המערכת מתפקדת ומוציאה מי תמלחות כ- 10 PPM כלורידים.